Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1O19441 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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H2-Q1O19441 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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