Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psmb1O09061 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmb1O09061 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms