Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snap23O09044 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snap23O09044 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms