Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MttpO08601 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MttpO08601 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MttpO08601 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MttpO08601 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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