Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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