Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efna5O08543 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efna5O08543 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms