Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efna4O08542 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms