Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MsmbO08540 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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