Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20878L7N244 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20878L7N244 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms