Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm5294J3QP53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm5294J3QP53 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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