Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
1700014D04RikJ3QMS2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700014D04RikJ3QMS2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms