Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20825J3QM67 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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