Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930544D05RikJ3QK56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930544D05RikJ3QK56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms