Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21411J3KMS0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms