Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20828J3KMI7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm20828J3KMI7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm20828J3KMI7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20828J3KMI7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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