Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pot1bH7BX60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms