Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HrcG5E8J6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms