Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf148G3X9R7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf148G3X9R7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms