Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms