Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msl3l2G3X992 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms