Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r167G3UW71 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms