Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
XntrpcF8VQM8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms