Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6F8VPZ5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ercc6F8VPZ5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms