Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28048F7BCN0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm28048F7BCN0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms