Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
D430041D05RikF6ZGR6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms