Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm8444F6XS56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm8444F6XS56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms