Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10477F6SW83 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10477F6SW83 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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