Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngap1F6SEU4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms