Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa35E9QLQ1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa35E9QLQ1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Defa35E9QLQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms