Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf165E9QAU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf165E9QAU8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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