Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cald1E9QA15 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms