Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms