Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930451I11RikE9Q9R3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms