Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Urb2E9Q7L1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Urb2E9Q7L1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms