Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf11E9Q6E5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf11E9Q6E5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms