Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc85cE9Q6B2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc85cE9Q6B2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms