Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17728E9Q5K2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17728E9Q5K2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms