Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm20518E9Q548 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms