Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc71lE9Q4T4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc71lE9Q4T4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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