Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r238E9Q373 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms