Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tarbp1E9Q368 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tarbp1E9Q368 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tarbp1E9Q368 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms