Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Krtap11-1E9Q2E9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms