Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrp3E9Q1T6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms