Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3893E9Q1I1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3893E9Q1I1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms