Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx60E9PZQ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Ddx60E9PZQ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx60E9PZQ1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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