Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chd2E9PZM4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms