Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms