Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc62E9PVD1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms