Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifit3bE9PV48 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms