Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl3E0CZ16 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms